Великобритания превысила один миллион последовательностей генома SARS-CoV-2 , загруженных в базу данных международной Глобальной инициативы по обмену данными о птичьем гриппе ( GISAID ), что означает, что на Великобританию приходится 24% всех образцов, загруженных во время пандемии. В GISAID база данных хранят геномные последовательности из разных стран мира , чтобы сообщить глобальную пандемия ответа.

Геномное секвенирование позволяет лучше понять, как развивается вирус, и помочь в принятии глобальных ответных мер на пандемию. Значительные открытия в Великобритании были сделаны в результате секвенирования генома во время пандемии коронавируса (COVID-19).

Сюда входит определение варианта Alpha, который помог объяснить эпидемиологические изменения в данных и передаче.

Отслеживая бета-вариант, который впервые был обнаружен в Южной Африке, Великобритания смогла обнаружить новые случаи и предотвратить широкую передачу.

Секретарь здравоохранения и социальной защиты Саджид Джавид сказал:

Великобритания является мировым лидером в области геномики, и наши научные эксперты играют жизненно важную роль в мировом сообществе, делясь своими знаниями и выводами в рамках всемирных усилий по борьбе с пандемией COVID-19.

Последовательность каждого отдельного теста помогает нам опережать варианты и узнавать больше об этом вирусе.

Недавно созданное Агентство безопасности здоровья Великобритании ( UKHSA ) будет на передовой, защищая страну от инфекционных заболеваний и других угроз общественному здоровью.

Основываясь на работе NHS Test and Trace в ходе пандемии, он отвечает за дальнейшее развитие возможностей Великобритании по секвенированию всего генома в партнерстве с научными организациями, включая Wellcome Sanger Institute и COVID-19 Genomics UK ( COG-UK). ) консорциум.

Д-р Дженни Харрис, исполнительный директор UKHSA , сказала:

Секвенирование одного миллиона геномов - огромное достижение и свидетельство научной силы и опыта Великобритании. Мы очень благодарны всем, кто упорно и с невероятной скоростью работал, чтобы это произошло.

Глобальное сотрудничество играет ключевую роль в борьбе с COVID-19, и UKHSA гордится тем, что играет свою роль. Британская технология секвенирования генома является ведущей в мире, и мы играем жизненно важную роль в обеспечении глобальной реакции на пандемию.

Полногеномное секвенирование ( WGS ) - это метод анализа полных геномов, который использовался для идентификации вариантов COVID-19 из образцов, взятых у инфицированных людей.

Великобритания начала секвенировать образцы от людей, инфицированных SARS-CoV-2 в марте 2020 года. Затем эти последовательности загружаются в международную базу данных GISAID . Это позволяет странам понять, что происходит на международном уровне, и принять меры, чтобы помочь смягчить передачу через границы, а также изолировать и реагировать на новые варианты.

Лаборатории, используемые для геномного секвенирования, расположены в разных странах, включая Глазго, Милтон-Кейнс, Ньюпорт и Антрим.

Новые варианты представляют собой наиболее серьезный риск для глобального выздоровления от пандемии, особенно те, которые обладают характеристиками, делающими их более передающимися, вызывают более тяжелые заболевания или с большей вероятностью ускользнут от иммунных ответов, развившихся в результате вакцинации или предшествующей инфекции. Понимая, какие варианты появляются и циркулируют в Великобритании и по всему миру, Великобритания может быстро отреагировать и предпринять шаги для обеспечения безопасности людей.

Посредством геномного секвенирования Великобритания выявила в общей сложности 5 вызывающих озабоченность вариантов и 11 вариантов, находящихся в стадии расследования, что помогло информировать общественное здравоохранение в ответ на пандемию.

Вклад Великобритании в GISAID делает ее второй по величине страной-участником и представляет около четверти всех глобальных образцов, секвенированных на сегодняшний день в мире. Посредством Новой платформы оценки вариантов ( NVAP ) Великобритания предоставляет свои ведущие в мире возможности другим странам для поддержки глобального ответа на пандемию.

Великобритания работает с глобальными партнерами, чтобы заполнить пробелы в глобальных возможностях секвенирования, либо помогая другим странам в создании их инфраструктуры секвенирования, либо обрабатывая образцы в Великобритании, если в стране нет возможности.

Используя научные возможности мирового класса Великобритании, UKHSA будет играть важную роль в защите людей от COVID-19 и будущих угроз здоровью как дома, так и за рубежом.

Профессор сэр Майк Страттон, директор института Wellcome Sanger, сказал:

Геномный надзор за SARS-CoV-2 имеет решающее значение для отслеживания пандемии в режиме реального времени. Геномные данные позволяют исследователям идентифицировать новые варианты вирусов, оценивать их относительную способность к распространению и помогают органам здравоохранения обнаруживать местные вспышки и быстрее реагировать на них.

Геномы также используются для разработки новых вакцин и бустеров вакцин и, что особенно важно, позволят обнаружить утечку вакцины, если это произойдет.

Создание более миллиона геномов SARS-CoV-2 является выдающимся свидетельством колоссальных усилий многих людей в Институте Wellcome Sanger, всей сети COG-UK и других местах, которые внесли свой разнообразный и разнообразный вклад.

Профессор Шэрон Пикок, исполнительный директор и председатель COG-UK, сказала:

С начала пандемии более 600 членов COG-UK из 4 агентств общественного здравоохранения, многочисленных университетов и института Wellcome Sanger неустанно работали над созданием геномов SARS-CoV-2 для поддержки пандемии и лучшего понимания вируса. и COVID-19.

Это было подкреплено сотрудничеством с испытательными лабораториями NHS, Lighthouse Laboratories, NHS Test and Trace и DHSC, а также с базой данных облачной инфраструктуры для микробной биоинформатики ( CLIMB ).

Мы рады, что в партнерстве с UKHSA в базу данных GISAID теперь помещен один миллион геномных последовательностей , что позволяет геномике патогенов использовать информацию для борьбы с инфекциями, политики общественного здравоохранения и разработки вакцин и терапевтических средств, а также способствует более глубокому пониманию SARS- CoV-2 биология и эволюция.